В файлом менеджере не хватает корзины, с возможностью восстановления удаленных файлов (не резервных копий). Аналогичную в cPanel. Так же, при наличии корзины, можно добавлять чекбокс "удалить пропустив корзину", а по умолчанию в корзину с периодом хранения 30 дней.